Для проверки поверхности HDD его не нужно форматировать или делать разметку, профильные утилиты его увидят и распознают без лишних телодвижений. Просто вставляешь в компьютер, заходишь в диспетчер устройств, ищешь диск в разделе "Дисковые устройства" (смотришь, что он подключён и работает). Дальше его проверишь в любой утилите вроде HDDScan на наличие большого количества медленным секторов (доступ от 500ms и выше) или битых.
P.S: Великий Windows вообще можно исключить из процесса проверки диска, записав на флешку образ проверочной утилиты и стартуешь из Bios с неё. Вся информация есть в интернет, оторвите 5ю точку и загуглите, 10 минут делов.